Yonatthan Rak fue presentado como nuevo jugador de Peñarol

En 2021, jugando en City Torque, Rak fue elegido como mejor defensa del Campeonato Uruguayo en la encuesta Fútbolx100 de El Observador con el 49% de los votos. Además, 74 en 100 le confiaron un lugar en el equipo ideal.

Comenzó su carrera en Miramar Misiones y debutó en 2013 en el Campeonato Uruguayo de Primera. En 2014 viajó a España a realizar la pretemporada con Cartagena, pero debido a deudas del club, que le impedían firmar pases del extranjero, volvió a Uruguay. Jugó el torneo de ascenso.

En julio 2015, Diego Aguirre lo recomendó como zaguero para ir formando para el futuro de Inter de Porto Alegre, y para alternar en Primera. Viajó por una temporada y se quedó un año y medio. Jugó con el sub 23 de Inter, nunca debutó en Primera y solo estuvo cuatro partidos como suplente en el plantel principal en el segundo semestre de 2016.

En 2017, con 23 años, volvió a Miramar para jugar en Segunda. Estuvo en todos los partidos del club y anotó dos goles. Al año siguiente desembarcó en Torque, cuando todavía no era Montevideo City Torque, aunque el Grupo City ya había llegado a Uruguay.

El año pasado se fue al club Tijuana y ahora, con 28 años, regresó para jugar en Peñarol.